本分署係由高屏澎東區就業服務中心及南區職業訓練中心合併而成。
高屏澎東區就業服務中心：
- 民國五十二年成立，名為台灣省南區國民就業輔導中心。
- 民國五十五年改為台灣省高雄區國民就業中心，隸屬於台灣省政府社會處。
- 民國七十七年一月十五日改隸台灣省政府勞工處。
- 民國八十三年七月配合組織規程修正更名為台灣省政府勞工處高雄區就業服務中心。
- 民國八十八年七月一日起改隸行政院勞工委員會職業訓練局高雄區就業服務中心。
- 民國九十四年八月更名為行政院勞工委員會職業訓練局高屏澎東區就業服務中心。
- 業務區包括高雄、屏東、澎湖、台東四縣，附設鳳山、岡山、屏東、潮州、澎湖、台東等六個就業服務站。
南區職業訓練中心：
- 成立於57年，原隸屬經濟部，為培訓其所屬各事業機構技術人力而設。
- 73年改隸內政部職業訓練局，為應經濟快速成長，所需各級技術人才逐年增加，加強推行職業訓練。
- 76年8月1日改隸行政院勞工委員會職業訓練局，為配合勞工政策之推行，對各級技工養成訓練暨技術人力供需作更有效之調節運用。